يحوي اقسام الرقود غرفاً عامة وخاصة وأجنحة مزودة بكافة الخدمات الطبية ووسائل الراحة بإشراف طبي مستمر وخدمات تمريضية على مدار الساعة وتشمل :

1- قسم رقود الخاص الجراحي :
تستقبل كافة الحالات الجراحية وتشرف على متابعتها من قبل الأخصائيين والأطباء المقيمين ويشمل ذلك جراحات الأورم وجراحات المناظير والجراحة العامة وجراحة المخ والأعصاب والعمود الفقري  ، جراحات العظام والكسور والمفاصل ، جراحات الأنف والأذن والحنجرة ، جراحات النساء والتوليد ، جراحات المسالك البولية والكلى ، جراحات الوجه والفكين.حيث يُعد قسم الجراحة من أهم الأقسام داخل المستشفى في تقديم أفضل الخدمات قبل وبعد العمليات.

2- قسم رقود الخاص الباطنية:
تستقبل كافة حالات أمراض الباطنية وتشرف على متابعة تنفيذ الخطط العلاجية والتشخيصية لمرضى الحالات الباطنية كأمراض القلب والرئتين وأمراض الكبد والكلي والسكري والأمراض المعدية والمزمنة وأمراض الجملة العصبية والأمراض الاستوائية والحميّات وأمراض الدم والأورام .

3- قسم الرقود العام (رجال – نساء )